L'Assemblée délibérante du SE38 est appelée Comité Syndical. Il est constitué d'un délégué titulaire et d'un délégué suppléant par commune et syndicat primaire adhérents, ainsi que de trois délégués titulaires et trois délégués suppléants représentant le Conseil Général.
Aujourd'hui il comprend 396 délégués, qui ont pour missions de :
Le Bureau syndical constitué de 31 délégués, a pour mission de préparer les comités syndicaux. Il assure également la répartition des aides financières pour les opérations des collectivités en amélioration esthétique, réseaux et éclairage public et acte les demandes de financement pour les opérations de maîtrise d'ouvrage.
Le Président est chargé de la gestion courante du Syndicat. Il établit les projets de budget, l'exécute une fois voté, et gère le personnel. Il étudie les dossiers en cours, prépare le planning du Syndicat et les rendez-vous avec les concessionnaires et autres partenaires.
Il s'appuie dans ses démarches sur cinq vice-présidents délégués pour gérer les quatre grands domaines d'activité du syndicat : concessions, maîtrise d'ouvrage, efficacité énergétique et administration générale.